ABSTRACT
Para evaluar la resistencia a fluoroquinolonas en aislamientos clínicos de cocos grampositivos se revisaron los resultados de los cultivos procesados en el Centro de Referencia Bacteriológica del Servicio Autónomo Hospital Universitario de Maracaibo, durante el periodo enero 2011-diciembre 2015. Los datos fueron analizados mediante el software WHONETTM, (versión 5,6) y el IBM® SPSS® Statistics para Windows, (versión 25). Se encontró una frecuencia de 29,70% para los cocos grampositivos (9.292 cepas), correspondiendo el 76,18% de los aislamientos al género Staphylococcus (7.072); 15,30% a Enterococcus (1.422) y 8,59% a Streptococcus (798). Para Staphylococcus, la resistencia fue mayor en cepas resistentes a meticilina. Las tasas de resistencia más elevadas se detectaron en los enterococos, especialmente en Enterococcus faecium resistente a vancomicina. No se detectó resistencia a fluoroquinolonas en las cepas de Enterococcus faecalis resistentes a vancomicina. Los estreptococos, incluyendo Streptococcus pneumoniae, se mostraron, mayormente, sensibles a las fluoroquinolonas. La mayoría de las cepas de estafilococos y enterococos; presentó, resistencia cruzada a todas las fluoroquinolonas probadas. La distribución de la resistencia a las fluoroquinolonas por año de estudio en cada género bacteriano fue diferente. La resistencia a las fluoroquinolonas muestra una tendencia creciente en los tres géneros de cocos grampositivos evaluados
To evaluate the resistance to fluoroquinolones in clinical isolates of Gram-positive cocci records of processed culture al the Bacteriological Reference Center of the Autonomous Service University Hospital of Maracaibo during the period January 2011-December 2015, were reviewed. The data was analyzed using WHONETTM software (version 5.6) and IBM® SPSS® Statistics for Windows (version 25). A frequency of 29.70% was found for Gram-positive cocci (9,292 strains), with 76.18% of isolates corresponding to the genus Staphylococcus (7,072); 15.30% to Enterococcus (1422) and 8.59% to Streptococcus (798). For Staphylococcus, resistance was higher in methicillin-resistant strains. The highest resistance rates were detected in enterococci, especially vancomycin-resistant Enterococcus faecium. No resistance to fluoroquinolones was detected in vancomycin-resistant Enterococcus faecalis strains. Streptococci, including Streptococcus pneumoniae, were mostly sensitive to fluoroquinolones. Most strains of staphylococci and enterococci; presented cross resistance to all tested fluoroquinolones. The distribution of resistance to fluoroquinolones per year of study in each bacterial genus was different. Resistance to fluoroquinolones shows an increasing trend in the three genera of Gram-positive cocci evaluated
ABSTRACT
Para determinar la susceptibilidad a meticilina y vancomicina en cepas de Staphylococcus aureus aisladas de hemocultivos, se analizaron los registros de pacientes ingresados en las Unidades de Cuidados Intensivos del Servicio Autónomo Hospital Universitario de Maracaibo durante el período enero 2011-diciembre 2015. Se procesaron 35.341 hemocultivos; 5.072 (14,35%) fueron positivos; en 455 (8,97%) se aislaron 96 cepas de Staphylococcus aureus (21,09%), de las cuales, 78 (81,25%) fueron resistentes y 18 (18,75%), sensibles a meticilina. Todos los aislados resultaron sensibles a vancomicina. El 61,45% de las cepas expresó multirresistencia. No se encontró diferencia estadísticamente significativa en la frecuencia de aislamiento de Staphylococcus aureus por año, edad y sexo del paciente (p > 0,05); pero si según el tipo de unidad y la presencia de co-resistencia antimicrobiana (p < 0,05). Los elevados niveles de resistencia a meticilina y la evidencia de fenotipos sensibles a vancomicina con valores elevados de concentración inhibitoria mínima (> 1 µg/ml), demandan la vigilancia sistemática del patrón de susceptibilidad antimicrobiana a fin de guiar a los clínicos para elegir la terapia empírica adecuada, contribuyendo al reforzamiento continuo de las precauciones estándar y al establecimiento de las políticas locales de administración y regulación del uso de antimicrobianos
To determine susceptibility to methicillin and vancomycin in blood-isolated strains of Staphylococcus aureus isolated from blood cultures, patient records entered in the Intensive Care Units of the Autonomous Hospital University Service of Maracaibo were analyzed during the period January 2011-December 2015. 35,341 blood cultures were processed; 5.072 (14,35%) were positive; in 455 (8.97%)96 strains of Staphylococcus aureus (21.09%) were isolated, of which 78 (81.25%) were resistant and 18 (18.75%), sensitive to methicillin. All isolates were sensitive to vancomycin. 61.45% of the strains expressed multi-resistance. No statistically significant difference in the frequency of isolation of Staphylococcus aureus per year, age and sex of the patient (p > 0.05) was found; but if according to the type of unit and the presence of antimicrobial co-resistance (p Ë 0.05). The high levels of methicillin resistance and the evidence of vancomycin-sensitive phenotypes with high minimum inhibitory concentration values (>1 µg/ml), require systematic monitoring of the antimicrobial susceptibility pattern in order to guide clinicians to choose appropriate empirical therapy, contributing to the continuous strengthening of standard precautions and the establishment of local policies for the administration and regulation of the use of antimicrobials
ABSTRACT
El agua de consumo humano y su calidad son determinantes para la salud pública. Esta revisión pretende recopilar y analizar información acerca de la relación entre la enfermedad diarreica en niños menores de cinco (5) años y la contaminación de las fuentes de agua subterránea. Se consultaron las bases: PubMed, ScienceDirect, SpringerLink, SciELO y Google Scholar, sin limitación en fechas de publicación; utilizando los descriptores: agua subterránea, diarrea, enfermedad gastrointestinal infantil, contaminación microbiana, calidad del agua, diarrea infantil, agua potable, técnicas moleculares y técnicas bioquímicas, analizándose un total de ciento sesenta y nueve (169) publicaciones. Se encontró relación entre la contaminación microbiana del agua subterránea y la diarrea infantil. El agua subterránea se contamina debido a fugas de fosas sépticas, métodos inadecuados de manejo de desechos y escorrentías de agua de lluvia, determinando la prevalencia de diarrea infantil. De allí, la importancia de monitorear la calidad del agua como factor de riesgo, con la detección y cuantificación de bioindicadores, mediante métodos rutinarios y novedosos, e incorporar intervenciones dirigidas a mejorar la accesibilidad a fuentes de agua controladas y la educación sanitaria en la búsqueda de asegurar la protección del agua y la disminución en la prevalencia de la diarrea infantil. Esta revisión está registrada en PROSPERO bajo el número ID 129254
Water for human consumption and its quality are determinants for public health. This review aims to collect and analyze information about the relationship between diarrheal disease in children under five (5) years of age and contamination of groundwater sources. The bases: PubMed, ScienceDirect, SpringerLink, SciELO and Google Scholar, without limitation on publication dates, using the descriptors: groundwater, diarrhea, childhood gastrointestinal disease, microbial contamination, water quality, childhood diarrhea, drinking water, molecular techniques and biochemical techniques, were consulted, analyzing a total of one hundred sixty-nine (169) publications. A relationship was found between microbial contamination of groundwater and childhood diarrhea. Groundwater is contaminated due to septic tank leaks, inadequate methods of waste management and rainwater runoff, determining the prevalence of childhood diarrhea. From there, the importance of monitoring water quality as a risk factor, with the detection and quantification of bioindicators, through routine and novel methods, and incorporating interventions aimed at improving accessibility to controlled water sources and health education in the search to ensure water protection and the decrease in the prevalence of childhood diarrhea. This revision is registered in PROSPERO under the number ID 129254.
ABSTRACT
La diarrea infecciosa es un importante problema de salud mundial; sin embargo, poco se sabe sobre su etiología en la ciudad de Shushufindi, Ecuador. El objetivo de esta investigación fue determinar la etiología de la diarrea infecciosa en niños. Se recolectaron 154 muestras fecales provenientes de niños de ambos sexos que acudieron al laboratorio de un centro de salud durante el periodo enero-marzo 2018. Se realizó coprocultivo, examen parasitológico directo e inmunoensayo cromatográfico. En 124 muestras (80,52%) se detectó la presencia de organismos enteropatógenos, de las cuales 74 (59,68%) fueron positivas para bacterias; 36 (29,03%) para parásitos y 14 (11,29%) para rotavirus. Los organismos aislados fueron: 35 (28,23%) Salmonella sp.; 26 (20,97%) Shigella sp.; 13 (10,48%) Campylobacter sp.; 15 (12,10%) G. intestinalis; 10 (8,06%) T. trichiura; 5 (4,03%) E. histolytica/dispar/moshkovskii; 3 (2,42%) A. lumbricoides; S. stercoralis y rotavirus14 (11,29%), cada uno. Se encontró asociación estadísticamente significativa entre la presencia de parásitos y la edad y sexo del paciente; así como también entre la presencia de bacterias y la edad de los niños. Este estudio demuestra la participación de un pequeño grupo de patógenos como los principales agentes causales de la diarrea infecciosa en la población infantil estudiada.
Infectious diarrhea is a major global health problem; however, little is known about its etiology in the city of Shushufindi, Ecuador. The objective of this investigation was to determine the etiology of infectious diarrhea in children. 154 fecal samples were collected from children of both sexes who attended the laboratory of a health center during the period January-March 2018. Stool culture, direct parasitological examination and immunochromatographic assay were performed. In 124 samples (80.52%) the presence of enteropathogenic organisms was detected, of which 74 (59.68%) were positive for bacteria; 36 (29.03%) for parasites and 14 (11.29%) for rotavirus. The isolated organisms were: 35 (28.23%) Salmonella spp.; 26 (20.97%) Shigella spp.; 13 (10.48%) Campylobacter spp.; 15 (12.10%) G. intestinalis; 10 (8.06%) T. trichiura; 5 (4.03%) E. histolytica/dispar/moshkovskii; 3 (2.42%) A. lumbricoides; S. stercoralis and rotavirus 14 (11.29%), each one. A statistically significant association was found between the presence of parasites and the age and sex of the patient; as well as between the presence of bacteria and the age of children. This study demonstrates the participation of a small group of pathogens as the main causative agents of infectious diarrhea in the child population studied.
ABSTRACT
A fin de establecer la frecuencia de aislamiento de las diferentes especies de enterococos, su distribución de acuerdo al tipo de muestra y servicio de atención al paciente y determinar la resistencia antimicrobiana, se analizaron 1.624 cepas provenientes de cultivos bacteriológicos de pacientes atendidos en el Centro de Referencia Bacteriológica del Servicio Autónomo Hospital Universitario de Maracaibo, durante el período Enero 2010 - Diciembre 2015. Las especies más frecuentes fueron E. faecalis (52,46%) y E. faecium (41,38%). El mayor número de cepas se obtuvo a partir de muestras de piel y tejidos blandos (54,92%), orina (23,15%) y sangre (17,27%). Los servicios con mayor frecuencia de aislamiento fueron: hospitalización de adultos (47,71%) y hospitalización pediátrica (16,38%). No se encontró asociación estadísticamente significativa entre la especie de enterococos y el tipo de muestra o el servicio de atención al paciente (p>0,05). Se detectó más resistencia en E. faecium que en E. faecalis. Los enterococos están adquiriendo cada vez mayor resistencia antimicrobiana y, por lo tanto, se hace necesario mantener una vigilancia permanente sobre ellos, realizar su adecuada identificación y detectar oportunamente la resistencia, con el fin de aplicar medidas preventivas adecuadas antes de que estos microorganismos causen un mayor impacto intrahospitalario.
In order to establish the frequency of isolation of the different species of enterococci, their distribution according to the type of sample and patient care service and determine the antimicrobial resistance, 1,624 strains obtained from bacteriological cultures of patients attended in the Bacteriological Reference Center at the Autonomous Service University Hospital of Maracaibo, during the period January 2010 - December 2015, were analyzed. The most frequent species were E. faecalis (52.46%) and E. faecium (41.38%). The greatest number of strains was obtained from skin and soft tissues samples (54.92%), urine (23.15%) and blood (17.27%). Services with increased frequency of isolation were: hospitalization of adults (47.71%) and pediatric hospitalization (16.38%). It did not find statistically significant association between the specie of enterococci and sample type, or patient care service (p > 0.05). It was detected more resistance in E. faecium than in E. faecalis. The enterococci are acquiring ever greater antimicrobial resistance, and therefore, it is necessary to maintain permanent vigilance over them, perform their proper identification and timely detect resistance, in order to apply preventive measures before these microorganisms cause a greater intrahospital impact.
ABSTRACT
Las infecciones urinarias son comunes en pacientes diabéticos. El objetivo de esta investigación fue: determinar la frecuencia, etiología, susceptibilidad antimicrobiana y factores de riesgo asociados a infección urinaria en pacientes con diabetes tipo 2. Se estudiaron 108 pacientes ambulatorios, con diagnóstico presuntivo de infección de vías urinarias, durante el periodo mayo 2016 - mayo 2017, en la ciudad de Jipijapa, Ecuador. Para el urocultivo se utilizó la técnica del asa calibrada. La susceptibilidad a los antibióticos se determinó mediante el método de Kirby & Bauer. Las variables cualitativas se compararon con ji cuadrado o la prueba exacta de Fisher. Se calculó el Odd radio (OR) y sus intervalos de confianza (IC) del 95%. Valores de p ≤ 0,05 fueron considerados significativos. La frecuencia de infección urinaria fue de 73,15%. El microorganismo más frecuentemente aislado fue Escherichia coli (78,48%). Los mayores porcentajes de resistencia se observaron para amoxicilina (78,87%) y cefalexina (71,83%). Los malos hábitos de higiene, la presencia de cálculos renales y una vida sexual activa resultaron factores de riesgo para las infecciones urinarias. La nitrofurantoina, fosfomicina, fluoroquinolonas y algunos betalactámicos, todavía representan una alternativa de utilidad en la quimioterapia de las infecciones urinarias no complicadas en pacientes diabéticos.
Urinary infection is common in diabetic patients. The objective of this research was to determine the frequency, etiology, antimicrobial susceptibility and risk factors associated with urinary tract infection in patients with type 2 diabetes. 108 outpatients with a presumptive diagnosis of urinary tract infection during May 2016-May 2017, in the city of Jipijapa, Ecuador, were studied. For the uroculture the calibrated loop technique was used. The susceptibility to antibiotics was determined by the Kirby & Bauer method. The qualitative variables were compared with chi-squared or Fisher's exact test. The Odd radio (OR) and its 95% confidence intervals (CI) were calculated. Values of p ≤ 0.05 were considered significant. A frequency of 73.15% of urinary infection was found. The microorganism most frequently isolated was Escherichia coli (78.48%). The highest percentages of resistance were observed for amoxicillin (78.87%) and cephalexin (71.83%). Bad hygiene habits, the presence of kidney stones and an active sex life were risk factors for urinary tract infections. Nitrofurantoin, fosfomycin, fluoroquinolones and some beta-lactams still represent a useful alternative in the chemotherapy of uncomplicated urinary tract infections in diabetic patients.
ABSTRACT
La presente investigación tuvo como objetivo establecer la frecuencia de aislamiento de las diferentes especies de estafilococos y determinar la resistencia antimicrobiana de las cepas aisladas. Se realizó un estudio retrospectivo, en cepas aisladas en el Centro de Referencia Bacteriológica del Servicio Autónomo Hospital Universitario de Maracaibo, durante el período enero 2011 diciembre 2015. Se obtuvo un porcentaje de aislamiento para S. aureus del 61,36% y 38,64% para coagulasa negativa, observándose mayor frecuencia de aislamiento en el área de hospitalización para ambos grupos de microorganismos. Las muestras de piel y tejidos blandos representaron las principales fuentes de aislamiento para S. aureus; mientras que para el grupo coagulasa negativa, fueron las muestras de sangre. Todas las cepas fueron sensibles a los glicopéptidos. La resistencia para los b-lactámicos fue acentuada para ambos grupos bacterianos, mostrando variabilidad para macrólidos y lincosamidas y para los restantes antibióticos probados, se encontraron bajos porcentajes de resistencia. Los resultados demuestran que S. aureus es la especie más frecuente del género; seguida de S. epidermidis y S. haemolyticus entre coagulasa negativa. Ambos grupos de microorganismos expresan fenotipos de resistencia a penicilina y eritromicina, sensibilidad a vancomicina y teicoplanina y susceptibilidad variable al resto de antibióticos evaluados.
The objective of the present investigation was to establish the frequency of isolation of the different species of staphylococci and to determine the antimicrobial resistance of the isolated strains. A retrospective study was carried out in isolated strains at the Bacteriological Reference Center of the Autonomous Service of the University Hospital of Maracaibo during the period January 2011 to December 2015. A percentage of isolation was obtained for S. aureus of 61.36% and 38,64% for coagulase negative, showing a higher frequency of isolation in the hospitalization area for both groups of microorganisms. Skin and soft tissue samples represented the main sources of isolation for S. aureus; while for the coagulase negative group, they were blood samples. All strains were sensitive to glycopeptides. Resistance for ß-lactams was accentuated for both bacterial groups, showing variability for macrolides and lincosamides and for the remaining antibiotics tested, low percentages of resistance were found. The results show that S. aureus is the most frequent species of the genus; followed by S. epidermidis and S. haemolyticus, among coagulase negative. Both groups of microorganism express phenotypes of resistance to penicillin and erythromycin, sensitivity to vancomycin and teicoplanin and variable susceptibility to the rest of evaluated antibiotics.
ABSTRACT
Staphylococcus aureus resistente a meticilina, es un importante patógeno nosocomial y comunitario. El determinante genético de resistencia es el gen mecA. Se han descrito 11 tipos de SCCmec, encontrándose con frecuencia los tipos II, III en infecciones hospitalarias, y los tipos IV y V en infecciones comunitarias. La presente investigación se llevó a cabo para estudiar la distribución de los tipos de SCCmec y su relación con la Leucocidina Panton-Valentine, tipificados mediante la reacción en Cadena de la Polimerasa. Para ello se estudiaron un total de 42 cepas resistentes a meticilina portadoras del gen mecA. Veintinueve (29) cepas mostraron la presencia del cassette cromosomal tipo IV (69,05%); 30,95% presentaron el SCCmec tipo I. Un 61,95% (n=13) de las cepas fueron portadoras del SCCmec IV resultando todas positivas para el gen PVL. Cabe destacar la diseminación del cassette tipo IV en cepas intrahospitalarias portadoras de PVL, lo que es preocupante tanto para la terapéutica como para el agravamiento de las infecciones en los pacientes.
Methicillin-resistant Staphylococcus aureus is an important nosocomial and community pathogen. The genetic determinant of resistance is the mecA gene. 11 types of SCCmec have been described, with types II, III frequently found in hospital infections, and types IV and V in community infections. The present investigation was carried out to study the distribution of the SCCmec types and their relation with the Panton-Valentine Leucocidin, typified by the reaction in the Polymerase Chain. To this end, a total of 42 methicillin-resistant strains carrying the mecA gene were studied. Twenty-nine (29) strains showed the presence of type IV chromosomal cassette (69.05%); 30.95% presented SCCmec type I. A 61.95% (n= 13) of the strains were carriers of SCCmec IV, all of which were positive for the PVL gene. It is worth noting the dissemination of the type IV cassette in intrahospital strains carrying PVL, which is worrisome both for the therapeutic and for the aggravation of infections in patients.
ABSTRACT
La alta incidencia de las enfermedades infecciosas y el aumento de la resistencia a los antibióticos se han convertido en la actualidad en un problema de salud pública, siendo las enterobacterias productoras de Betalactamasas de Espectro Extendido (BLEE) un ejemplo de este fenómeno. En el presente estudio se determinó la producción de BLEE en aislados clínicos de la familia Enterobacteriaceae procedentes de una institución de salud de la ciudad de Maracaibo, durante el periodo septiembre de 2014 a febrero de 2015. Para la detección de BLEE se utilizó como método preliminar el de Kirby-Baüer, siguiendo los lineamientos del CLSI; adicionalmente se utilizó como prueba confirmatoria fenotípica el método de sinergia del doble disco y como prueba confirmatoria genotípica la detección de los genes blaCTX-M, blaTEM y blaSHV mediante PCR. Se analizaron 55 enterobacterias productoras de BLEE, distribuidas de la siguiente manera: Escherichia coli 56,36%, Klebsiella pneumoniae 21,82%, Enterobacter cloacae 7,27%, Proteus mirabilis y Serratia marcescens 5,45% para cada especie, por último, Salmonella spp. y Morganella morganii 1,82% respectivamente. En cuanto al tipo de BLEE detectado mediante PCR, se observó que el 83,63% de los aislados presentó el tipo TEM, seguido de CTX-M (23,63%) y SHV (21,81%), mientras que el 27,27% de los aislados produjo dos o tres BLEE de manera simultánea. Los resultados de este estudio confirman la alta diseminación de este mecanismo de resistencia entre las enterobacterias productoras de infecciones en nuestras instituciones públicas de salud, por lo que deben aplicarse medidas de control que permitan controlar y disminuir su incidencia.
The high incidence of the infectious diseases and the antimicrobial resistance arise represent a public health threat today. The extended-spectrum ß-lactamase (ESBL)-producing Enterobacteriaceae are an example of this phenomenon. We determined the ESBL-production in Enterobacteriaceae isolates from a Healthcare Center in Maracaibo, during September 2014 to February 2015. The Kirby-Baüer method was perform to preliminary phenotypic detection of ESBL, according to CLSI guidelines. ESBL-production was confirmed by a double-disk synergy test according to the CLSI standards. To genotypic confirmation, the genes blaCTX-M, blaTEM and blaSHV were amplified by PCR. Fifty-five (n=55) strains were analyzed distributed in Escherichia coli (56.36 %), Klebsiella pneumoniae (21.82 %), Enterobacter cloacae (7.27 %), Proteus mirabilis and Serratia marcescens (5.45 % each one), Salmonella spp. and Morganella morganii (1.82 % each one). The major encoded ESBL was the blaTEM gene (83.63 %); followed by 23.63% of the blaCTX-M gene, and 21.81 % encoded the blaSHV gene. 27.27 % of the isolates produced two or three ESBL simultaneously. These results confirmed the high spread of this resistant mechanism among Enterobacteriaceae-producing infections in our public health institutions, therefore control measures should applied to control and reduce its incidence.
ABSTRACT
La resistencia a los antimicrobianos en bacterias Gram positivas como Staphylococcus coagulasa negativa constituye una amenaza mundial emergente. El propósito de la presente investigación fue identificar los genes de resistencia a oxacilina (mecA), eritromicina (erm y msrA), y gentamicina aac(6´)/aph(2´´), en cepas de Staphylococcus coagulasa negativa aisladas de hemocultivos de pacientes atendidos en el Hospital Universitario de Maracaibo. La detección fenotípica se realizó mediante métodos automatizados. Se utilizó la reacción en cadena de la polimerasa para detectar la presencia de genes de resistencia a los antimicrobianos. Se estudiaron 34 cepas cuya distribución por especie fue: S. haemolyticus (38,23%), S. epidermidis (29,42%), S. hominis (26,47%), S. xylosus y S. capitis (5,88% cada uno). Todas las cepas fueron resistentes a oxacilina. La resistencia a gentamicina varió entre 38,46% y 100%; mientras que la resistencia a eritromicina osciló entre 77,78% y 100%. Los análisis mostraron la presencia de los genes mecA (100%), ermA (35,2%), ermC (41,17%), msrA (17,64%), y aac(6´)/aph(2´´) (61,76%). En conclusión, se encontró una alta frecuencia de genes de resistencia a estos antibióticos y la Unidad de Cuidados Intensivos fue el servicio médico donde se aisló el mayor porcentaje de cepas portadoras de estos genes.
Resistance to antimicrobials in Gram-positive bacteria such as coagulase negative Staphylococcus is an emerging global threat. The purpose of this research was to identify the genes for resistance to oxacillin (mecA), erythromycin (erm and msrA), and gentamicin aac(6´)/aph(2´´), in Staphylococcus coagulase negative strains isolated from blood cultures from patients attended at the University Hospital in Maracaibo. Phenotypic detection was performed using automated methods. Polymerase chain reaction was used for the detection of antimicrobial resistance genes. Be studied 34 strains whose distribution by species was: S. haemolyticus (38.23%), S. epidermidis (29.42%), S. hominis (26.47%), S. xylosus and S. capitis (5.88% each one). All strains were resistant to oxacillin. Gentamicin resistance varied between 38.46% and 100%; while the erythromycin resistance ranged between 77.78% and 100%. The analyses showed the presence of genes mecA (100%), ermA (35.2%), ermC (41.17%), msrA (17.64%), and aac(6´)/aph (2´´) (61,76%). In conclusion, is found a high frequency of genes for resistance to these antibiotics and the intensive care unit was the health service where the highest percentage of isolated strains carriers of these genes.
ABSTRACT
Staphylococcus aureus es un importante patógeno involucrado en una serie de infecciones cuyo impacto se incrementa por sus múltiples factores de virulencia y su resistencia a los antimicrobianos. La resistencia a clindamicina inducida por eritromicina constituye un problema creciente en diversas partes del mundo. Este estudio fue de tipo retrospectivo y se analizó el comportamiento frente a los antimicrobianos de 4307 cepas de Staphylococcus aureus aisladas en un hospital de la ciudad de Maracaibo entre enero 2006 y diciembre de 2013. Se determinó la frecuencia de resistencia a clindamicina inducida por eritromicina, su asociación con la resistencia a oxacilina y el origen biológico de las muestras a partir de las cuales se aisló el microorganismo. La susceptibilidad a oxacilina se comprobó mediante el método de difusión con discos en agar y la resistencia inducida a clindamicina usando la prueba D-test. Se detectaron 60 cepas D-Test positivo (1,39%), de las cuales 38(63,33%) fueron sensibles a meticilina y 22 cepas fueron resistentes (36,67%). La resistencia total a clindamicina (constitutiva e inducida) representó el 31,43% (1354) del total de cepas evaluadas. La frecuencia de resistencia inducida a clindamicina en cepas de Staphylococcus aureus en la localidad es aún baja tanto en cepas sensibles como resistentes a meticilina.
Staphylococcus aureus is an important pathogen involved in a series of infections whose impact is increased by its multiple factors of virulence and antimicrobial resistance. Erythromycin-induced clindamycin resistance is a growing problem in various parts of the world. This study was retrospective and analyzed the behavior in response to antimicrobials of 4307 strains of Staphylococcus aureus isolated in a hospital in the city of Maracaibo between January 2006 and December 2013. The frequency of erythromycin-induced clindamycin resistance, its association with resistance to oxacillin and the biological origin of the samples from which the microorganism was isolated were determined. Susceptibility to oxacillin was checked by diffusion method with disk agar and the induced clindamycin resistance was evaluated using the D-test. 60 D-Test positive strains were detected (1.39%), of which 38 (63.33%) were sensitive to methicillin and 22 strains were resistant (36.67%. The total resistance to clindamycin (constitutive and induced) represented 31.43% (1354) of the total number of strains tested. The frequency of induced resistance to clindamycin in Staphylococcus aureus strains in the locality is still low for both methicillin sensitive and resistant strains.
ABSTRACT
Staphylococcus aureus resistente a meticilina (SAMR) presenta una proteína de unión a la penicilina, la PBP2a codificada por el gen mecA, que se encuentra en un elemento genético móvil llamado cassette cromosómico estafilocócico (SCCmec). El presente estudio se realizó para examinar la susceptibilidad antimicrobiana, producción de leucocidina de Panton-Valentine (PVL) y tipo de SCCmec presente en cepas aisladas de 54 pacientes en un hospital durante un período de tres meses. Las pruebas de susceptibilidad antimicrobiana se realizaron mediante el método de difusión en agar y el mecA, PVL y los tipos de SCCmec se determinaron usando la reacción en cadena de polimerasa (PCR). Veintinueve (29) cepas correspondieron al SCCmec tipo IV (54%), 22 al SCCmec tipo I (40%), 2 al SCCmec tipo IA (4%) y 1 al SCCmec IIIB (2%). Diecinueve cepas (35%) resultaron positivas para PVL, todas SCCmec tipo IV. Cuarenta cepas (74%) expresaron multi-resistencia. Todos los aislamientos fueron sensibles a vancomicina, teicoplanina, linezolid, tigeciclina y moxifloxacina. No se encontró asociación estadísticamente significativa entre la presencia del gen PVL, la resistencia antimicrobiana y el tipo de SCCmec (p>0,05). Los SCCmec tipos IV y I son los más frecuentes en las cepas SAMR circulantes en la institución.
Methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) presents a protein that binds to penicillin, the PBP2a, encoded by the gene mecA, located in a mobile genetic element called the staphylococcal chromosomal cassette (SCCmec). This study was conducted to examine the antimicrobial susceptibility, Panton-Valentine leukocydine (PVL) production and the staphylococcal chromosomal cassette mec (SCCmec) type for MRSA isolates from 54 patients in a hospital during a three-month period. Antimicrobial susceptibility testing was performed using an agar diffusion method; mecA, PVL and SCCmec types were determined using polymerase chain reaction (PCR). Twenty-nine strains (29) corresponded to type IV SCCmec (54%), 22 to type I SCCmec (40%), 2 to type IA SCCmec (4%) and 1 to SCCmec IIIB (2%). Nineteen strains (35%) were positive for PVL, all of type IV SCCmec. Forty strains (74%) expressed multiresistance. All MRSA isolates were susceptible to vancomycin, teicoplanin, linezolid, tygecicline and moxifloxacina. No statistically significant association was found between the presence of the PVL gene, antimicrobial resistance and the SCCmec type (p>0.05). SCCmec types IV and I are the most frequent in the MRSA strains circulating in the institution.
ABSTRACT
Con el propósito de detectar la colonización gastrointestinal por S. aureus y evaluar los factores de riesgo asociados (edad, género, origen del paciente, hospitalización previa, uso de antibioterapia, corticoides o inmunoterapia previa, motivo y origen de hospitalización) se procesaron 50 hisopados rectales, de pacientes de la Unidad de Cuidados Intensivos del Servicio Autónomo Hospital Universitario de Maracaibo, durante un período de tres meses. El aislamiento e identificación bacteriana se efectuó siguiendo la metodología convencional. Las pruebas de susceptibilidad antimicrobiana se efectuaron de acuerdo al método de Kirby-Bauer. Del total de muestras procesadas (n=50), 12 (24%) resultaron positivas para S. aureus y 7 (14%) lo fueron para SAMR. El 75% de las cepas presentó multi-resistencia a los antibióticos. No se identificó ninguna asociación entre los factores de riesgo y los pacientes que introdujeron S. aureus en las UCI del hospital; pero sí para el tipo de UCI y la hospitalización previa para SAMR. En uno de los pacientes se evidenció co-colonización gastrointestinal por enterococos resistentes a vancomicina. En conclusión, los resultados obtenidos sugieren que la colonización gastrointestinal por S. aureus y/o SAMR en pacientes de UCI, representa un reservorio de cepas multi-resistentes que pueden provocar a futuro, infecciones de origen exógeno o endógeno.
With the purpose of detecting gastrointestinal colonization by S. aureus and evaluating the associated risk factors (age, gender, origin of the patient, prior hospitalization, use of antibiotic therapy, corticosteroids or previous immunotherapy, motive and origin of hospitalization), 50 rectal swabs from patients in the intensive care unit of the Autonomous Service at the Maracaibo University Hospital were processed over a three-month period. Bacterial isolation and identification was performed following conventional methodology. Antimicrobial susceptibility tests were carried out according to the Kirby-Bauer method. Of the total processed samples (n=50), 12 (24%) were positive for S. aureus and 7 (14%) for MRSA; 75% of the strains showed multi-resistance to antibiotics. No association between risk factors and the patients who introduced S. aureus into the hospital ICU was identified; however, association was found between the type of ICU and prior hospitalization for MRSA. One of the patients showed gastrointestinal co-colonization by vancomycin-resistant enterococci. In conclusion, the results suggest that gastrointestinal colonization by S. aureus and/or MRSA in ICU patients represents a reservoir of multi-resistant strains that can lead to future infections of an exogenous or endogenous origin.
ABSTRACT
Pseudomonas aeruginosa es considerado uno de los patógenos nosocomiales más importantes, siendo común su aislamiento en pacientes de unidades de cuidados intensivos, en quienes además suele presentar multirresistencia, esto limita enormemente las opciones terapéuticas para el tratamiento del paciente, lo que constituye un problema ya que no se disponen de drogas efectivas para el tratamiento. El presente trabajo tiene como objetivo evaluar cuatro métodos fenotípicos para la detección de metalo-beta-lactamasas (método de sinergia del doble disco con EDTA, método del disco combinado de imipenem y meropenem con EDTA, método de E-Test-MBL y el método de Hodge modificado), con un método de referencia (PCR), para determinar el método fenotípico o combinación de estos que sea más valido y seguro para su implementación en los laboratorios de bacteriología de rutina. La sensibilidad y especificidad de los métodos fenotípicos empleados fue buena (más de 90%), de los métodos empleados, el test de Hodge modificado fue el que proporcionó mejores resultados en la detección de aislados de P. aeruginosa productores de MBL (menor tasa de falsos positivos y negativos), al analizar los diferentes métodos combinados para determinar cuál es la asociación con mayor sensibilidad y especificidad, el método del doble disco asociado con el test de Hodge modificado reunieron estas características, estos resultados sugieren que estos dos métodos se deben emplear de rutina en un laboratorio de Bacteriología, por ser fáciles de realizar, económicos, sensibles y específicos.
Pseudomonas aeruginosa is considered one of the most important nosocomial pathogens. Its isolation is commonin intensive care unit patients who also usually have multi-resistance. This greatly limits therapeutic options, since no effective drugs are available for treatment. The study aims to evaluate four phenotypic methods for detecting metallo-beta-lactamases. The double disc synergy with EDTA method, combined imipenem and meropenem disk with EDTA method, the E-Test-MBL method and the modified Hodge method, along with a reference method (PCR), are used to determine the phenotypic method or a combination of these is used that is more valid and safe for implementation in routine bacteriology laboratories. The sensitivity and specificity of the phenotypic methods used was good (over 90%); the modified Hodge test obtained the best results in detecting MBL-producing P. aeruginosa isolates (lower rate of false positive and negative). On analyzing the different combined methods for determining the association with greater sensitivity and specificity, the double disc method associated with the modified Hodge test met these characteristics. Results suggest that these two methods should be routinely used in a bacteriology laboratory, since they are easy to perform, sensitive, specific and economical.
ABSTRACT
Se determinó la resistencia antimicrobiana mediante métodos fenotípicos y genotípicos a 106 cepas de S. aureus aisladas de pacientes atendidos en el Centro de Referencia Bacteriológica del Servicio Autónomo Hospital Universitario de Maracaibo durante el primer trimestre del 2009. El cultivo, aislamiento e identificación se realizó siguiendo la metodología convencional. Fenotípicamente, 103 cepas (97,17%) resultaron resistentes a penicilina G; 54 (50,94%) a meticilina; 43,39% a eritromicina (46) y 34,91% (37) a gentamicina. Además, 13 (12,26%) se mostraron intermedias a eritromicina. Genotípicamente, 90 cepas (84,91%) portaban el gen blaZ mediante la reacción en cadena de la polimerasa (PCR); 53 (50%) acarreaban el gen mecA; sólo 10 (9,43%) albergaban el gen aac(6)/aph(2); el gen ermA se detectó en 41 aislados (38,68%) y msrA en 17 (16,04%). Los resultados discordantes fueron: (1) Una cepa mecA-negativa; pero resistente a meticilina, la cual resultó blaZ-positiva e hiperproductora de b-lactamasas; (2) Una cepa resistente a eritromicina y negativa para los genes ermA, B, C y msr y; (3) veintiséis cepas gentamicina-resistentes; pero negativas para aac(6)/aph(2). Los fenotipos y genotipos de resistencia antimicrobiana están relacionados; sin embargo, existe una marcada variabilidad en los determinantes genéticos de la resistencia lo que repercute, indudablemente en su expresión fenotípica. Para oxacilina y en menor proporción para eritromicina, existe una buena concordancia entre los fenotipos y genotipos de resistencia encontrados; observándose la mayor discrepancia en los aminoglicósidos, y penicilina G.
Antimicrobial resistance was determined for 106 S. aureus strain isolates from patients treated in the Bacteriological Reference Center at the University Hospital Autonomous Service, Maracaibo, during the first trimester of 2009, using phenotypic and genotypic methods. Culture, isolation and identification were performed following conventional methodology. Phenotypically, 103 strains (97.17%) were resistant to penicillin G; 54 (50.94%) to methicillin; 43.39% to erythromycin (46) and 34.91% (37) to gentamicin. In addition, 13 (12.26%) were intermediate to erythromycin. Genotypically, 90 strains (84.91%) carried the blaZ gene through the polymerase chain reaction (PCR); 53 (50%) carried the mecA gene; only 10 (9.43%) harbored the gene aac(6)/aph(2); the gene ermA was detected in 41 isolates (38.68%) and msrA in 17 (16.04%). The discordant results were: (1) A mecA-negative, but methicillin-resistant strain, which proved blaZ-positive and hyper-productive of b-lactamases; (2) An erythromycin-resistant strain, negative for ermA, B, C and msrA genes, and; (3)Twenty-six gentamicin-resistant strains, negative for aac(6)/aph(2). The phenotypes and genotypes of antimicrobial resistance are related; however, there is a marked variability in the genetic determinants for resistance, which undoubtedly affects phenotypic expression. For oxacillin and, to a lesser degree erythromycin, there is a good match between the resistance phenotypes and genotypes found, noting the greatest discrepancy in the aminoglycosides and penicillin G.
Subject(s)
Humans , Drug Resistance, Microbial , Genotype , Phenotype , Staphylococcus aureus , Bacteriological Techniques/methods , BacteriologyABSTRACT
Las especies que conforman el género Enterococcus, son cocos Gram positivos, que usualmente habitan el tracto intestinal de humanos y animales, pero que también pueden ser aislados de fuentes ambientales. Son capaces de sobrevivir a un amplio rango de condiciones ambientales adversas de estrés, lo que les permite colonizar un amplio rango de nichos, incluidos los ambientes hospitalarios. La patogenicidad nosocomial de los enterococos ha emergido en los últimos años, así como su incrementada resistencia a los antibióticos glicopéptidos. El presente estudio intenta determinar la resistencia a vancomicina de cepas de Enterococcus faecium aisladas en un hospital universitario en el período enero-diciembre del año 2009, así como caracterizar el determinante genético responsable de la resistencia. Para ello se utilizaron los métodos para determinar susceptibilidad a glicopéptidos descritos por el CLSI, adicionalmente se determinó el elemento genético responsable de la resistencia mediante la reacción en cadena de la polimerasa. El 48,81% de las cepas de E. faecium estudiadas fueron resistentes a vancomicina y el PCR demostró la presencia del gen vanA que confiere altos niveles de resistencia a glicopéptidos. Debido al elevado número de aislados resistentes a vancomicina dentro de la institución se sospecha de la presencia de un brote nosocomial producido por este microorganismo; esta cepa epidémica poseedora del gen vanA posiblemente está dispersa en los diferentes servicios de la institución, por lo que se sugiere realizarestudios epidemiológicos para determinar el rol que este microorganismos juega en la producción de infecciones nosocomiales en la institución estudiada
Genus Enterococcus species are gram positive cocci, usually inhabitants of human and animal intestinal tracts, but can also be isolated from their environmental sources. They are able to survive a wide range of adverse environmental stress conditions, allowing them to colonize a wide range of niches, including hospital environments. Nosocomial pathogenicity of enterococci has emerged in recent years, as well as their increased resistance to glycopeptide antibiotics. This study attempts to determine the resistance to vancomycin of Enterococcus faecium strains isolated in a university hospital during the January-December period of 2009, as well as to characterize the genetic determinant responsible for its resistance. Methods to determine susceptibility to glycopeptides described by CLSI were used; additionally, the genetic elements responsible for resistance were identified using the polymerase chain reaction. Of the E. faecium strains studied, 48.81% were resistant to vancomycin, and PCR showed presence of the vanA gene that confers high levels of resistance to glycopeptides. Due to the large number of isolates resistant to vancomycin, the presence of a nosocomial outbreak produced by this microorganism was suspected; this epidemic strain possessing a vanA gene is possibly scattered in different services of the institution; therefore, epidemiological studies should be performed to determine the role this microorganism plays in the production of nosocomial infections in the institution under study
Subject(s)
Humans , Intestinal Diseases/drug therapy , Enterococcus faecium , Vancomycin Resistance , Bacteriological Techniques/methodsABSTRACT
Los glicopéptidos (vancomicina y teicoplanina) constituyen una alternativa terapéutica en el tratamiento de infecciones severas por cepas de S. aureus resistentes a meticilina. Sin embargo, ya se han descrito dos mecanismos de resistencia en S. aureus: resistencia de bajo nivel, caracterizada por un engrosamiento anormal de la pared celular, presente en las cepas VISA y, resistencia de alto nivel mediada por el operón vanA, que provoca la sustitución de los residuos terminales D-ala-D-ala por D-ala-D-lac, disminuyendo su afinidad por el antibiótico. Esta revisión resume la historia de la aparición de la resistencia a glicopéptidos en S. aureus y considera los mecanismos que determinan la resistencia en estos organismos como base para comprender la necesidad y los potenciales roles de nuevos agentes de esta clase
Glycopeptides (vancomycin and teicoplanin) are an alternative therapeutic in the treatment of severe infections by methicillin-resistant S. aureus strains. However, two resistance mechanisms of S. aureus have already been described: low-level resistance, characterized by an abnormal thickening of the cellular wall, present in the VISA strains, and high-level resistance, mediated by the vanA operon, which causes the replacement of D-ala - D-ala terminal residues by D-ala-D-lac, decreasing its affinity for the antibiotic. This review summarizes the history of the emergence of glycopeptide resistance in S. aureus and considers the mechanisms that determine the resistance in these organisms as a background for understanding the need and potential roles of new agents of this kind
Subject(s)
Humans , R Factors/therapeutic use , Infections/drug therapy , Infections/therapy , /therapeutic use , Staphylococcus aureus , Teicoplanin/therapeutic use , Vancomycin/therapeutic useABSTRACT
S. aureus ha demostrado un gran poder de adaptación a los agentes antimicrobianos, adquiriendo paso a paso resistencia a todos los antibióticos disponibles para el tratamiento de las infecciones que ocasiona. Existen tres mecanismos de resistencia a los antibióticos ß-lactámicos en S. aureus: resistencia mediada por enzimas (penicilinasas o ß-lactamasas) las cuales desactivan al antibiótico; resistencia intrínseca, que no es debida a la inactivación de drogas y es responsable dela resistencia a meticilina; y la modificación de las proteínas de unión a penicilinas (PBPs). Además, S. aureus puede expresar el fenómeno de tolerancia, en el que ocurre una disociación de las acciones inhibitoria y bactericida de los antibióticos ß-lactámicos. De éstos, el mecanismo más importante, es la resistencia intrínseca que es probablemente más compleja, debido a que varios factores pueden afectar también su expresión
S. aureus has shown a great power of adaptation to antimicrobial agents, acquiring, step-bystep, resistance to all available antibiotics for treatment of the infections it causes. S. aureus has three major mechanisms of resistance to ß-lactam antibiotics: enzyme mediated (penicillinase or ß-lactamase) by which the antibiotic is inactivated; intrinsic resistance, which is not due to drug inactivation and accounts for methicillin resistance; and modifications of penicillin-binding proteins (PBPs). Additionally, S. aureus can express the tolerance phenomenon, in which there is a dissociation of the inhibitory and killing actions of ß-lactam antibiotics. Of these, the most important mechanism is intrinsic resistance, which is probably more complex because several factors can affect its expression